對于深港通，有個問題必須要關注，那就是交易貨幣和匯率，那具體該注意點什么呢?
1、交易貨幣：港股通交易以港幣報價，投資者以人民幣交收。
2、中國結算提供交易參考匯率(包括港幣人民幣買入價、港幣人民幣賣出價)，每個工作日開市前參考匯率通過交易系統發送，由深交所SPV轉發至參與港股通的深交所會員，同時在深交所SPV的指定網站上發布，讓投資者了解到當天的匯率情況。深交所SPV在其指定網站上代中國結算發布結算匯率。
3、參考匯率是指，在港股通交易日開市前，由中國結算根據換匯銀行提供、并通過上交所網站向市場公布的匯率。參考匯率包括港幣買入參考價、港幣賣出參考價兩項。境內證券公司可能利用該參考匯率作為控制投資者資金之用。
結算匯兌比率是指，當日收盤后，中國結算根據全市場港股通成交的清算凈額(單邊，凈應收或凈應付)，在香港與換匯銀行換匯后，將換匯成本均攤至根據當日所有買入成交和賣出成交所計算出的對投資者當日成交進行人民幣資金結算所實際適用的匯率。結算匯兌比率包括買入結算匯兌比率和賣出結算匯兌比率兩項。
券商給投資者每日的買賣參考匯率都有一個比較寬的價差，實際結算價格以結算匯率為準。每日交易開市前和閉市后，中國結算分別提供當日交易的參考匯率和結算匯率，并在深交所SPV指定網站上發布。
4、每日額度計算公式中的買入申報金額、賣出成交金額、被撤銷和被聯交所拒絕接受的買入申報金額、買入成交價低于申報價的差額，按照中國結算每日交易開始前提供的當日交易參考匯率，由港幣轉換為人民幣計算。
5、深港通與滬港通每日參考匯率相同，結算匯率可能不同。
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